(1)点グラフを描く
   GD::Graph::points;
(2)マーカーの長さを決める
  marker_size => 6, #点グラフ及び折れ線+点（linespoints）
                    #グラフの点（マーカー）の大きさ(ﾋﾟｸｾﾙ)。
                    #デフォルト: 4。
(3)マーカーの表示順番を決める
  markers => [ 9, 10, 1, 7, 5 ], #デフォルトは、[1,2,3,4,5,6,7,8] 。


   # データセットとの対応で指定します。
   #以下のマーカー数字で指定します。
   # 1:塗りつぶされた四角（filled square）
   # 2:四角（open square）
   # 3:十字（horizontal cross）
   # 4:対角線の十字(diagnal cross)
   # 5:塗りつぶされた菱形（filled diamond）
   # 6:菱形（open diamond）
   # 7:塗りつぶされた丸（filled circle）
   # 8:丸（open circle）
   # 9:横線（horizontal line)
   # 10:縦線（virtical line)
   # デフォルトは[1,2,3,4,5,6,7,8]
   #(左画像は上からデフォルト値です）
   # マーカーの色は、dclrsで指定します。色のデフォルトは、
#[ qw(lred lgreen lblue lyellow lpurple cyan lorange) ] です。
#デフォルトは7色です。

■sample31.pl

chdir("C:\\Inetpub\\wwwroot\\uriage"); #カレントディレクトリ指定（IISの場合）
use lib 'C:/Inetpub/wwwroot/uriage'; #GD::Graphライブラリ格納フォルダ GD （固定）の場所
#
use GD::Graph::points;
require 'save.pl';

print STDERR "Processing sample31\n";

@data = ( 
    ["1st","2nd","3rd","4th","5th","6th","7th", "8th", "9th"],
    [    5,   12,   24,   33,   19,    8,    6,    15,    21],
    [    1,    2,    5,    6,    3,  1.5,    undef,     3,     4],
);

$my_graph = new GD::Graph::points();

$my_graph->set( 
	x_label => 'X Label',
	y_label => 'Y label',
	title => 'A Points Graph',
	y_max_value => 40,
	y_tick_number => 8,
	y_label_skip => 2, 
	legend_placement => 'RC',
	long_ticks => 1,
	marker_size => 6,
	markers => [ 9, 10, 1, 7, 5 ],

	transparent => 0,
);

$my_graph->set_legend( qw( one two ) );
$my_graph->plot(\@data);
save_chart($my_graph, 'sample31');


(参考）

　　●本ソースコードの1〜3行目（挿入）
           1 chdir("C:\Inetpub\wwwroot\uriage"); #カレントディレクトリ指定（IISの場合）
           2 use lib 'C:/Inetpub/wwwroot/uriage'; #GD::Graphライブラリ格納フォルダ GD （固定）の場所
           3 #
           Windows IIS 走行用に元ソースに挿入
　　●>save.pl（グラフ画像保存ルーチン）